公司按国家相关法律法规和政策建立法人治理结构，内设20个部室，下设2个分公司、5个全资子公司、3个控股子公司、3个参股子公司。

17个部室：党群工作部、办公室、工会办公室、保卫保障部、财务部、人力资源部、企业管理部、技术管理部、质量安全监察部、合约法规部、纪检监察部、审计与风险防控部、信息管理部、资源经营管理部、机电设备部、征迁工作部、土地事业部。

3个项目管理部：工程建设项目管理三、五部，第二调度中心项目管理部。

2个分公司：金年会体育app建设分公司、金年会体育app运营分公司。

5个全资子公司：郑州市轨道交通置业有限公司、金年会体育app颐嘉实业有限公司、郑州兴龙城市发展有限公司、金年会体育app咨询有限公司、郑州尚瑞房地产开发有限公司。

3个控股子公司：郑州市轨道交通设计研究院有限公司、河南中报轨道文化传媒有限公司、河南郑洛城际铁路有限公司。

3个参股子公司：郑州城市一卡通有限责任公司、郑州中建深铁轨道交通有限公司、郑州时代交通电气设备有限公司。